單細胞RNA-seq揭示了細胞群中固有的細胞異質(zhì)性，這在許多臨床和研究應用中非常重要。液滴微流體學的最新進展已經(jīng)實現(xiàn)了液滴隔室中單細胞的自動分離，裂解和標記，而無需復雜的儀器。然而，細胞包封過程中發(fā)生的條形碼錯誤是由于珠子中的多珠和由于低濃度的珠子以避免多個珠子在液滴中而導致的通量不足仍然是精確和有效的表達譜分析的重要挑戰(zhàn)單細胞
在這項研究中，三星基因組研究所的研究人員開發(fā)了一種新的基于液滴的微流體平臺，通過確定性封裝慣性有序珠子，顯著提高了通量，同時減少了條形碼錯誤。含有寡核苷酸條形碼的高度濃縮的珠子通過慣性效應在螺旋通道中自發(fā)排序，然后逐個包裹在液滴中，同時將細胞同時包封在液滴中。
盡管珠子濃度增加到1000μl-1，但珠子的確定性包封導致高比例的單珠子在液滴中并且稀有的多珠子在液滴中，這減少了條形碼誤差并且使得精確的高 - 吞吐量條形碼。研究人員用單細胞RNA-seq成功驗證了他們的裝置。此外，他們發(fā)現(xiàn)了多個珠子在一個小滴，使用具有高濃度珠子的正常Drop-Seq裝置，低估的轉(zhuǎn)錄物數(shù)量和高估的細胞數(shù)量產(chǎn)生。這種精確的高通量平臺可以擴展Drop-Seq在單細胞分析中的能力和實用性。
移動通過螺旋渠道的小珠的微觀圖象。(比例尺表示500μm)
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