美國MD安德森癌癥中心聯(lián)合瑞典卡羅林斯卡學(xué)院的研究人員利用單細(xì)胞測序?qū)θ幦橄侔┱归_分析，表明耐藥性是來源于現(xiàn)有的帶有基因突變的克隆。這些結(jié)果于周四發(fā)表在《Cell》雜志上，將對這種癌癥的診斷、預(yù)后和治療具有臨床意義。
三陰乳腺癌是指雌激素受體、孕激素受體和原癌基因Her-2均為陰性的乳腺癌。這種癌癥約占乳腺癌的10%-15%，可能對新輔助化療有反應(yīng)，但通常會產(chǎn)生耐藥性。不過，人們尚不清楚耐藥性究竟是由罕見的現(xiàn)有克隆引起，還是由新獲得的基因組異常引起。
于是，美國MD安德森癌癥中心聯(lián)合瑞典卡羅林斯卡學(xué)院的研究人員利用單細(xì)胞測序對三陰乳腺癌展開分析，表明耐藥性是來源于現(xiàn)有的帶有基因突變的克隆。這些結(jié)果于周四發(fā)表在《Cell》雜志上，將對這種癌癥的診斷、預(yù)后和治療具有臨床意義。
“在這項(xiàng)研究中，我們研究了三陰乳腺癌患者在接受新輔助化療時(shí)腫瘤細(xì)胞的基因組和表型進(jìn)化，他們表現(xiàn)出兩種截然不同的克隆動態(tài)：消退或持續(xù)，”作者寫道。
對于一些乳腺癌患者，化療清除了所有的腫瘤細(xì)胞。然而，另一些患者在化療后仍有殘留的腫瘤細(xì)胞，其基因型和表型在治療后都發(fā)生改變。
為此，研究人員利用單細(xì)胞DNA和RNA測序，以及大量細(xì)胞的外顯子組測序，分析了20名治療過程中的三陰乳腺癌患者。Illumina深度外顯子組測序發(fā)現(xiàn)10名患者的腫瘤消退，而另10名患者仍有腫瘤細(xì)胞存在。之后，他們對其中的8名開展了單細(xì)胞分析。
他們使用BD的FACSAria II流式細(xì)胞儀來分選單個(gè)細(xì)胞，并利用混合文庫和Illumina的新一代測序技術(shù)來分析。他們通過DNA測序分析了900個(gè)單細(xì)胞，通過RNA測序分析了6,862個(gè)細(xì)胞，發(fā)現(xiàn)化療中出現(xiàn)的拷貝數(shù)畸變是預(yù)先存在且適應(yīng)性選擇的，而表達(dá)譜是通過轉(zhuǎn)錄重編程獲得的。
“我們的數(shù)據(jù)進(jìn)一步表明，新輔助化療選擇的一小部分基因型被用于轉(zhuǎn)錄重編程，并在治療之前表達(dá)出耐受化療的基因，”研究人員指出。盡管這項(xiàng)研究的樣本量很小，但是它對臨床具有重要意義。
作者還寫道：“在接受化療之前，檢測三陰乳腺癌患者的耐藥克隆，也許有助于預(yù)測哪些患者有望從化療中受益。其次，將患者分化為克隆消退組和克隆持續(xù)組，可能對患者的預(yù)后或生存有意義。第三，我們關(guān)于耐藥表型的數(shù)據(jù)有望開發(fā)出克服耐藥性的治療策略。”
未來的研究將包括配對的原發(fā)性和轉(zhuǎn)移性腫瘤的分析，以便了解耐藥克隆在轉(zhuǎn)移中的作用。研究人員表示，隨著單細(xì)胞DNA測序的產(chǎn)量增加及成本下降，以及同一細(xì)胞的單細(xì)胞DNA和RNA分析變得可行，這些項(xiàng)目將變得更加可行。
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